在墨兰的栽培过程中，软腐病危害比较普遍和严重，严重时甚至全部死亡。[8]
防治方法：
- 加强检疫：为了防止软腐病从外地传入，在调运兰花种苗、兰株等繁殖材料或成品材料时，必须经过检疫，在取得检疫部门签发的植物检疫证书后，方可调运。
- 选择无病繁殖材料： 由于病原菌可经病株传播，在兰株繁殖时（多为分株繁殖），必须选用健康无病的兰株作母株，发现病株立刻销毁，并对剪刀等工具进行消毒，以培养无病种苗。有条件的兰场最好建立健康种苗的自繁自育制度，尽量不从其他兰场购买种苗，以确保种苗无病。
- 种苗消毒：为了减少和避免由种苗带菌传播，在兰株分株繁殖时应对种苗消毒。消毒方法：数量较少时，用毛笔蘸70%甲基托布津粉直接涂上切口。数量较大时，用70%甲基托布津500倍液喷洒切口和根部，晾半天后栽种。
- 使用一次性植料、盆具：墨兰软腐病原菌可经栽培基质等传播，因此种植墨兰时，提倡使用一次性植料，而不提倡使用传统的种兰植料塘泥。旧的植料一不用，也不能用新旧料混合种兰，以免造成病菌传播。为了避免病原菌经盆具传播，要选择新盆具。如果名贵盆具不舍得弃用，也要放在阳光下暴晒一段时间，然后用药剂消毒后才可使用。
- 改变分株时间：把春季分株改为秋季分株。传统的分株时间多数在春季进行，但春季由于雨水多、湿度大，分株时形成的切口容易感染病菌，同时由于春季气温较低，切口愈合较慢，从而增加了病菌感染的机会。而秋季气温25℃-30℃左右，切口愈合较快，且秋季湿度较小，病菌感染机会较少。
- 加强肥水管理：在春季施8克/盆酵素菌能有效减轻软腐病病害。冬春季也可施3克/盆好康多和奥绿肥长效肥，肥效可达半年。分株后不要立刻浇水，以免切口感染病菌，分株2-3天后再浇水。在水分的日常管理中，保持基质湿润即可，特别是在4-7月软腐病高发时期不宜大量浇水，如果天气干燥，可以采用向叶面、地面、空中洒水的方式来保持空气湿度。
- 搞好兰场卫生：在兰场的日常管理中，要及时清理落叶、枯叶、兰株残体，并集中处理，减少病菌附生。发现病株，要立刻销毁，减少传染源，同时对整个兰场进行消毒。此外，春季可施熟石灰粉50千克/亩1-2次，直接撒于整个兰园，石灰粉可起消毒作用，不会灼伤兰叶和兰株。
- 改善环境条件：兰花喜阴凉，耐干旱，宜通风，忌污染。散射光有利于兰花的生长，而强烈的直射光不利于兰花的生长。场地闭塞、通风不良会导致兰花生长受阻，并容易感染病虫害。因此，兰棚周边离地1米高处要开通透风，通风方式为自然通风、风扇辅助通风。在广东地区，冬春季至夏初（11月至翌年5月）遮盖遮光率为75%～85%的遮阳网，6-10月需遮盖双层遮阳网。
- 合理使用农药： 在充分了解农药性能和使用方法的基础上，根据原菌种类对症下药，使用合适的农药类型或剂型。兰花软腐病主要以防为主，兰花分株后3个月内、4-8月及夏季大雨之后，要特别注意用药，每隔15天左右用药一次，可选用大生300倍液、灭病威300倍液、70%甲基托布津800倍液等药剂，注意交替使用。
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